Skip to main content

Table 1 Relationship between molecular descriptors and anti-HIV activity in human PBM cells

From: Diverse models for anti-HIV activity of purine nucleoside analogs

Serial number

Basic structure of compound

Substituent (R)

A2

A4

A23

A37

Anti-HIV activity in human PBM cells (EC50)

Predicted

Reported [25]

A2

A4

A23

A37

 

1

I

3-[4-(Hydroxymethyl)-2-cyclopent-1-yl]

0.919

3.287

9.61

2.16

+

+

±

−

+

2

I

3-(β-D-1,3-Dioxolanyl)

0.922

3.1

9.982

2.254

+

+

±

−

+

3

I

3-(3-Azido-2,3-dideoxy-β-D-erythro-pentofuranosyl)

0.903

4.599

50.599

2.197

+

+

+

−

+

4

I

3-(β-D-2-C-Methyl-ribofuranosyl)

0.848

0.001

615.521

2.332

−

−

−

−

−

5

II

4-MeO-Ph

0.973

11.666

4.866

1.596

−

−

−

−

−

6

II

4-Me-Ph

0.972

11.15

5.338

1.614

−

−

−

−

−

7

II

4-Br-Ph

0.97

11.545

3.883

1.631

−

−

−

−

−

8

II

4-NEt2-Ph

0.976

14.051

43.583

1.531

−

−

+

+

+

9

II

4-NMe2-Ph

0.976

12.597

43.44

1.573

−

−

+

+

+

10

II

2-Thiophenyl

0.968

9.999

5.937

1.655

−

−

−

−

−

11

II

3-Thiophenyl

0.969

10.637

5.223

1.641

−

−

−

−

−

12

III

Et

0.945

6.157

7.307

1.938

−

−

−

−

−

13

III

Ph

0.971

9.869

2.313

1.674

−

−

−

−

−

14

III

4-MeO-Ph

0.974

11.602

4.849

1.627

−

−

−

−

−

15

III

3-MeO-Ph

0.974

10.545

5.38

1.652

−

−

−

−

−

16

III

2-MeO-Ph

0.97

9.834

6.121

1.678

−

−

−

−

−

17

III

4-Me-Ph

0.973

11.081

5.436

1.648

−

−

−

−

−

18

III

4-Cl-Ph

0.971

11.307

4.712

1.661

−

−

−

−

−

19

III

4-F-Ph

0.971

10.929

5.132

1.655

−

−

−

−

−

20

III

2,4-F-Ph

0.971

10.969

35.94

1.672

−

−

±

−

−

21

III

4-NEt2-Ph

0.974

13.458

44.566

1.555

−

−

+

+

+

22

III

4-NMe2-Ph

0.976

12.544

44.599

1.601

−

−

+

−

−

23

III

2-Thiophenyl

0.969

9.92

6.049

1.69

−

−

−

−

−

24

III

3-Thiophenyl

0.97

9.951

5.261

1.675

−

−

−

−

−

25

III

4-N3-Ph

0.961

12.091

4.532

1.611

−

−

−

−

−

26

III

4-CN-Ph

0.975

12.57

4.893

1.626

−

−

−

−

−

27

IV

Ph

0.939

0.566

6.494

1.645

−

−

−

−

−

28

IV

4-MeO-Ph

0.889

1.923

39.143

1.609

−

−

±

−

−

29

IV

4-NEt2-Ph

0.907

4.048

357.424

1.551

+

+

+

+

+

30

IV

4-NMe2-Ph

0.901

2.76

344.712

1.589

+

+

+

+

+

31

V

Et

0.878

0.018

993.843

1.986

−

−

−

−

−

32

V

4-MeO-Ph

0.937

0.982

1972.793

1.663

−

−

−

−

−

33

V

4-NEt2-Ph

2.345

0.94

16,083.229

1.594

−

−

−

−

−

34

V

4-NMe2-Ph

0.983

0.939

12,785.121

1.639

−

−

−

−

−

35

V

2-Thiophenyl

0.123

0.923

2081.689

1.72

−

−

−

−

−

36

V

3-Thiophenyl

0.122

0.923

2059.054

1.706

−

−

−

−

−

  1. +, active; −, inactive; ±, transitional